Hallo,
bei mir "verschwinden" scheinbar auch immer Mails. Ich kenne die Forums-Software auch nicht im Detail, aber mir fallen vorerst 2 Gründe auf.
1. Wenn die Nachricht noch nicht gelesen wurde, dann kann der Sender die zurückrufen. Dann hat man ggf. die Benachrichtigung per E-Mail bekommen, aber wenn man ins Postfach schaut, ist da keine neue Nachricht.
2. Die Sortierung der Nachrichten ist sinnfrei. 1. Sortierkriterium ist anscheinend der gelesen/ungelesen Status und 2. Kriterium das Datum. Soweit noch halbwegs logisch. Als gelesen werden nur Nachrichten gewertet, die in der Detailansicht angeschaut wurden und nicht nur in der Übersicht gelesen wurden. Das Problem ist nun, dass für den gelesen/ungelesen-Status offenbar alle Nachrichten in dem Thread zählen. Wenn die Gegenseite eine Nachricht von einem selbst nicht in der Detailansicht angeschaut hat, dann bleibt diese Nachricht als ungelesen markiert. Und damit bleibt der gesamte Thread als ungelesen markiert und oben. Wenn die Gegenseite immer die Nachrichten in der Detailansicht anschaut, dann wandert der ganze Thread als gelesen nach unten, hinter die vermeintlich ungelesenen Nachrichten. Wenn man viele vermeintlich ungelesene Thread, dann findet man das irgendwo auf Seite 2, 3, 4, .. wieder.

Workaround: Wenn man auf Postbox klickt, dann unten rechts auf "Alle anzeigen" klicken. Dann soweit runterscrollen, bis die offenen Umschläge kommen und gucken, ob die gesuchten Nachrichten da zu finden sind.
Eine wirklich Lösung wäre es, die Nachrichten nur nach Datum zu sortieren oder für den gelesen/ungelesen Status nur die Mails zu berücksichtigen, die man selbst gelesen hat. Dann kann man das selbst steuern. Aktuell hängt die Sortierung davon ab, ob die Gegenseite in der Detailansicht liest oder nicht und das ist völlig sinnlos.
Wie eingangs gesagt: ich kenne die Software nicht im Detail. Das ist nur aus den sichtbaren Symptomen abgeleitet. Möglicherweise stellt sich die Ursache mit Blick auf den Programmiercode noch etwas anders dar.
Beste Grüße
Guido